Bảo tàng Đà Nẵng - Cơ sở 2 được khởi công xây dựng mới vào năm 2012, đưa vào sử dụng năm 2018 với tổng diện tích 7.200m2 với 2.700 m2 diện tích trưng bày bên trong với hơn một ngàn hiện vật. Trong đó, tầng 3 là không gian trưng bày cố định, giới thiệu về 05 chủ đề: Dấu ấn người cổ Bàu Dũ, Sa Huỳnh; Văn hóa Chămpa trên đất Quảng Nam; Quảng Nam buổi đầu khai phá và dựng nghiệp đến năm 1858; Quảng Nam từ 1858 đến 1975; Quảng Nam thời kỳ xây dựng, đổi mới và phát triển.
Thông qua các chủ đề, công chúng được chiêm ngưỡng, trải nghiệm về những di vật, cổ vật liên quan đến các bộ sưu tập giá trị, tiêu biểu như:
Bộ sưu tập hiện vật di cốt người cổ có niên đại trên năm ngàn năm, mai táng theo hình thức chôn bó gối được tìm thấy tại di chỉ Bàu Dũ (xã Tam Xuân, thành phố Đà Nẵng hiện nay)
Bộ sưu tập mộ chum và đồ tùy táng của nền văn hóa Sa Huỳnh, gồm công cụ lao động, vật dụng sinh hoạt, vũ khí, trang sức của người cổ thời kỳ sơ sử;
Bộ sưu tập hiện vật về Văn hóa Chămpa hết sức phong phú, trong đó có Bảo vật quốc gia đầu tượng thần Siva, thế kỷ X, chất liệu bằng hợp kim, trong đó vàng chiếm tỷ lệ lớn nhất, và là một trong hai đầu tượng cực kỳ quý hiếm hiện có ở Việt Nam tính đến thời điểm hiện nay;
Bộ sưu tập gốm sứ thương mại Việt Nam khai quật từ tàu cổ đắm Cù Lao Chàm với hơn 13.000 đơn vị hiện vật thời kỳ nửa sau thế kỷ XV đến thế kỷ XVI là minh chứng cho thời kỳ thịnh vượng của đồ gốm xuất khẩu Việt Nam, đồ gốm Việt Nam không chỉ được xuất khẩu đến Đông Nam Á mà còn được xuất khẩu tới Nhật Bản, Trung Đông và các nước Châu Âu.
Và nhiều bộ sưu tập khác như: Bộ sưu tập những hiện vật đặc trưng về đời sống vật chất, văn hóa tinh thần của các dân tộc thiểu số ở miền núi; bộ sưu tập về công cụ lao động, sản xuất và các hiện vật, tư liệu về đời sống văn hóa tinh thần, nghệ thuật sân khấu, lễ hội của người Việt từ thời di dân, lập ấp, khẩn hoang đến ngày nay, trong đó nổi bật với những hình ảnh, hiện vật thuộc thời kỳ đấu tranh dựng nước, cứu nước của con người xứ Quảng.
